Emmaüs participeert in het bestuur van de volgende organisaties:
- centrum voor geestelijke gezondheidszorg (CGG) De Pont - www.cggdepont.be
- Vereniging Ambulante Geestelijke Gezondheidszorg Antwerpen (VAGGA) - www.vagga.be
- Vzw GZA-groep - www.gza.be
- Vzw Woon- en Zorgcentrum Zoersel
Emmaüs werkt nauw samen met koepelorganisaties. Medewerkers leveren zo een bijdrage aan overleg en besluitvorming voor de sector. Dat gebeurt onder meer met de volgende organisaties.
- Caritas Vlaanderen - www.caritas.be
- Zorgnet Vlaanderen - www.zorgnetvlaanderen.be
- Vlaams Welzijnsverbond - www.vlaamswelzijnsverbond.be
- Regionaal overleg gehandicaptenzorg (ROG) Antwerpen - http://www.provant.be/welzijn/zorg_en_hulp/gehandicapten/
- Medisch-sociale sector In Dialoog (MID) - www.mid.be
- Partezis - www.partezis.be